Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms