Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms