Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms