Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gm3415J3QMS8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm3415J3QMS8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm3415J3QMS8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm3415J3QMS8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm3415J3QMS8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm3415J3QMS8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm3415J3QMS8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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