Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms