Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms