Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vmn1r167G3UW71 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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