Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms