Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zfp988F6VKC7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zfp988F6VKC7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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