Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Myo5cE9Q1F5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Myo5cE9Q1F5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms