Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms