Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms