Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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