Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmf1B9EKI3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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