Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Brpf1B2RRD7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Brpf1B2RRD7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Brpf1B2RRD7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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