Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Ssxb8B1AY40 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms