Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gbp4A4UUI3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gbp4A4UUI3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms