Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms