Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.3 ms