Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms