Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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