Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psma1Q9R1P4 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms