Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Wdr54Q9R0D8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms