Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms