Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp29Q9ES63 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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