Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnft1Q9DCN7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms