Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pop7Q9DCH2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pop7Q9DCH2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms