Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms