Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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