Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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