Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Srp19Q9D7A6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms