Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfn4Q9D6I3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms