Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PudpQ9D5U5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms