Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms