Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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