Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx29Q9D3S3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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