Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fndc8Q9D2H8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fndc8Q9D2H8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fndc8Q9D2H8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fndc8Q9D2H8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fndc8Q9D2H8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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