Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trappc6bQ9D289 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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