Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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