Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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