Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcf1Q9CTH6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcf1Q9CTH6 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Fcf1Q9CTH6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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