Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snw1Q9CSN1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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