Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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