Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Commd4Q9CQ02 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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