Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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