Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms