Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab28Q99KL7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms