Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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