Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Csmd1Q923L3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms