Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Nek8Q91ZR4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nek8Q91ZR4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms